Την Τετάρτη 20 Αυγούστου 2014, ο Σεβ. Μητροπολίτης Ρεθύμνης και Αυλοποτάμου κ. Ευγένιος επισκέφθηκε την ανασκαφή του Τμήματος Ιστορίας και Αρχαιολογίας του Πανεπιστημίου Κρήτης στον Τομέα ΙΙ της Αρχαίας Ελεύθερνας, κατόπιν προσκλήσεως της Καθηγήτριας Βυζαντινής Αρχαιολογίας του Τμήματος κ. Τσιγωνάκη Χριστίνας, η οποία και τον διευθύνει.
Ο Επίσκοπός μας είχε την ευκαιρία να ξεναγηθεί λεπτομερώς απότην κ. Τσιγωνάκη στην Ακρόπολη, το υδραγωγείο και τις δεξαμενές της αρχαίας πόλης καθώς και να συνομιλήσει με την ομάδα των 15 φοιτητών, οι οποίοι συμμετέχουν εφέτος στην ανασκαφή και εκπαιδεύονται στην ανασκαφική τεχνική.
Η πανεπιστημιακή αυτή ανασκαφή, που πραγματοποιείται κάθε χρόνο το δεύτερο δεκαπενθήμερο του Αυγούστου, φωτίζει την ιστορία της πάλαι ποτέ διαλαμψάσης Επισκοπής Ελευθέρνης, η οποία περιλαμβάνεται στην σημερινή Ιερά Μητρόπολη Ρεθύμνης και Αυλοποτάμου.